Нужно вызывать пересчет суммы, при добавлении и удалении строки в табличную часть документа.
В каких процедурах, или процедуре это правильно сделать?

(0) А зачем? Есть же Итог.

Дополню товарища H A D G E H O G s:
Лучшие мотивационные курсы - это ветки Осипова, Шекина и Широносова на мисте

(1) Да, есть. Я и узнаю.
//
&НаКлиенте
Процедура ЛимитыПриИзменении(Элемент)
    ИтогПоСумме();
КонецПроцедуры
//
&НаКлиенте
Процедура ЗаявкиНаРасходованиеПриИзменении(Элемент)
    ИтогПоСумме();
КонецПроцедуры
//
//
&НаСервере
Процедура ИтогПоСумме()
    Объект.СуммаПоДокументам = Объект.Лимиты.Итог("СуммаСчета") + Объект.ЗаявкиНаРасходование.Итог("Сумма");
КонецПроцедуры
//

(3) Да все верно. Какой не уверенный Ночной охотник :)

Только на Сервер ходить не надо. Клиент тоже посчитает.