На форму элемента справочника драг-дропом вытащил команду(из глобальных) создания документа
Теперь потребовалось передать параметры.
Можно ли это сделать и как или рисовать свою команду-кнопку?

Создай реквизит формы - Ссылка нужного типа и подключи его в качестве параметра команды. Ну и при любом изменении нужного значения, обновляй этот реквизит.

(1) это независимые команды, не привяжешь параметр ((
создал команду формы

(2) Если команда независимая, то сам вопрос некорректен. Параметры можно передавать только параметризованным командам.