Попробуйте
https://wonderland.v8.1c.ru/blog/optimizatsiya-restrukturizatsii-bazy-dannykh/?sphrase_id=386044
Чтобы использовать новый механизм реструктуризации, вы можете запустить Конфигуратор в пакетном режиме. Кроме этого в файле conf.cfg вы также можете указать необходимость использования нового механизма. Тогда новая реструктуризация будет выполняться при нажатии Конфигурация – Конфигурация базы данных – Обновить конфигурацию базы данных на сервере.