Перешли с НГ на новую конфу, внесли остатки и начали работать.
По итогу приходиться отключать контроль остатков товаров организаций периодически для проведения продаж.
Помощник исправления остатков товаров организаций всегда показывает 0 отрицательных остатков и развернутого сальдо, но если тыкнуть в этот 0 запускается отчет который показывает кучу отрицательных остатков.
Вопрос следующий сталкивался ли кто с таким поведением в УТ 11.5.

Так может посмотреть, почему остатки отрицательные?

(1)  Вот разбираюсь.

Интеркампани запускать с контролем остатков по организации, знатные выдумщики

(3) ахах)
(0) Интеркомпани как раз позволяет продавать в минус товар, перепродажами между организациями этот вопрос решается, есть даже помощник штатный для этого дела. По поводу отрицательных остатков, можете просто сформировать отчет Себестоимость товаров предприятия, в структуре отчета вывести номенклатуру в разрезе Организации+Склада. Там вы свои минусы увидите (можете заранее отобрать, чтобы только минуса выходили).

(4) Сразу отбирать, это такое, надо будет не забыть отключить потом при детализации по документам, иначе можно словить проверку на знание организации БД

(0) А как внесли остатки?

Оказалось дело было в списаниях которые провели в минус когда еще не было настроек интеркампани, запустил задание свертки и от мени проведение списания и заново его провел и тогда ситуация нормализовалась ну или почти, помощник заработал.