Добрый день.

В ЗУП 3.1 в позиции штатного расписания сидит ФОТ за 2022 год.
Сейчас делаем совмещение в 2023 году, ФОТ берет тот что есть в позиции штатного расписания, то есть за 2022 год.
Можно создать документ "Изменение штатного расписания" с 01.01.23, и в нем пересчитать ФОТ (пересчитывается нормально, ставит за 23 год).

Пересчет планового ФОТ с 01.12.22 делал, не повлияло.

Вопрос: изменение штатного расписания каждое начало года что-ли делать, или есть какой=то другой способ обновления ФОТ в позиции штатного расписания?

Проверь в начислении флажок "Входит в ФОТ".

(1) флажок стоит

(0) А что,  у вас начисление "Совмещение" запланировано в штатке (Т-3) ?