Добрый день!
Как поступить в ситуации когда в аванс рассчитался и удержался НДФЛ, затем сотрудник принес уведомление на вычеты.
В зарплату применяются вычеты и выплачивается вся зарплата. Но с аванса остается исчисленная, удержанная и перечисленная НДФЛ (по регистру налогового учета).
В начислении за февраль НДФЛ рассчитывается с минусом - в расчетном листе появляется минус в удержаниях (хотя в январе НДФЛ в расчетном листе не было) и справочно указывается НДФЛ к зачету в будущих периодах. Зарплата за февраль выплачивается вся. Если делать возврат НДФЛ, то выплата получается больше на сумму НДФЛ.

(0) Никак не поступать
Жить себе дальше, начислять зарплату за следующие периоды.

(1) а если вычет до конца года? Понятно, руками придется выкручивать, а таких ситуаций по году множество будет, за всеми сложно уследить.

НДФЛ накопительно считается. С ближайшим начислением предоставятся всё необходимые вычеты.

(2) "а если вычет до конца года? "

Видимо, это имущественный вычет на сумму, которая точно превысит сумму зарплаты.
Тогда НДФЛ нужно возвращать (ст. 231 НК РФ)

Делай документ "Возврат НДФЛ".

" Если делать возврат НДФЛ, то выплата получается больше на сумму НДФЛ."

Верно.
Но обрати внимание, что если этого документа не делать, то выплата получается = начислено - удержано - принято к зачету в связи с отрицательным НДФЛ.
Т.е. когда программа налог принимает к зачету - она уменьшает сумму к выплате на сумму отрицательного налога.

Пример: начислено 10 000, НДФЛ получился -1300, ожидаешь, что к выплате будет 10 000 - (-1300) = 11300, а в ведомость идет 10 000.
Вот эти 1300 программа не возвращает без твоего одобрения.
Одобрением является возврат НДФЛ

(5) Вся контора кинулась покупать виллы на ЧП ? :)
Учитывая слова автора "таких ситуаций по году множество будет" я думаю речь идет о более популярном дитячьем вычете

(6) Да кто ж его знает... сумм конкретных не написал.

(6) с вычетам на детей обычно нет проблем, не такие большие суммы, можно подождать когда они зачтутся. В данном случае это имущественные вычеты, которых хватит до конца года.

(5) Точно! Вот сейчас получается как Вы описали. Получается остаётся, если взять Ваши цифры, эта сумма 1300 (НДФЛ к зачету в счет будущих платежей). Если на них делать возврат, то сумма выплат будет больше сумм начислений. Если ничего не делать, то 1300 висит в расчетном листке и в налоговом регистре. Получается как то нужно этот НДФЛ закрыть.


Получается так:

Расчетный лист в Январе
Начислено 10000
Удержан НДФЛ 0
Выплачено 10000

Налоговый регистр в Январе
Начислено 10000
Исчислен НДФЛ 1300
Удержан НДФЛ 1300
Перечислен НДФЛ 1300

Расчетный лист в Феврале
Начислено 10000
Удержан НДФЛ -1300
Выплачено 10000
Справочно (НДФЛ к зачету в счет будущих платежей) 1300             

Налоговый регистр в Феврале
Начислено 10000
Исчислен НДФЛ -1300
Удержан НДФЛ -1300
Перечислен НДФЛ 0


По налоговому регистру остается перечисленная сумма НДФЛ 1300.