Ситуация: Предприятие работает с НДС и без НДС, делает штуковины. Есть проект условно на 100 штуковин, которые будут делаться  и отгружаться по 10 штуковин в квартала, т.е. на несколько лет. Проект без НДС. Для производства штуковин требуется детали, которые покупаются.

И вот в 1кв 23 куплены детали на все 100 штуковин, а передаваться на проект по производству они будут еще несколько лет. Однако может предти начальник цеха и сказать: нам тут для другой штуковины не хватает детали, и забрать деталь предназначенную для проекта, а потом докупить и вернуть. Т.е. детали вроде как под проектом, но и не совсем.

И есть статья 170 НК РФ п.4: "учитываются в стоимости таких товаров (работ, услуг), имущественных прав в соответствии с пунктом 2 настоящей статьи - по товарам (работам, услугам), в том числе основным средствам и нематериальным активам, имущественным правам, используемым для осуществления операций, не облагаемых налогом на добавленную стоимость; "

И вот на конец 1 кв на складе лежит деталей на  200 млн. р. (без НДС) купленных под проект. Если считать, что они куплены "для осуществления операций, не облагаемых налогом на добавленную стоимость" то НДС должен быть включен в стоимость, а если считать что они неизвестно чьи, то можно принять к вычету.

Как нетрудно посчитать: разница в декларации по НДС будет 40 млн. р..

Так вот вопрос: как налоговая может проверить принадлежность деталей на складе?

При оприходовании принимаете НДС к вычету, а когда используете для не НДС - восстанавливаете принятый к вычету НДС.

(1) Это все понятно. Но боюсь когда подадим корректировочную декларацию на минус 40 млн.р. к нам придут.

(2) и что. У вас есть, что скрывать?

(2) Так детали уже все приняли без НДС, а его весь же поставили к вычету??

(3) Мне так по фиг, но когда поведут к фин директору объяснять, почему предприятие заплатило "лишние" 40 млн.р. очень хочется иметь обоснование, почему так делать нельзя.

(4) Первый квартал сделали без вычета, однако из-за того, что детали приходили под БезНДС, а потом уходили под НДС, по 19-68-19 гуляли суммы. Сказали сделать, чтобы НДС определялся  в момент передачи в производство. Я сделал. Посмотрели на новую декларацию за 1 кв, а там на 40 млн.р. меньше.

НДС это сладкое слово. У нас кристально чистые налоговики и налогоплательщики, если только где-то высоко в горах, но не в нашем районе, да...
Поэтому поговорим о Гондурасе. Там до сих пор возвращает бюджет НДС фирмам живыми деньгами.
Для этого существует целая цепочка посвящённых, тех кто при делах: налоговики, их же юристы, посредники и т.д.
В результате идёт откат от десятины и выше. Когда люди видят 40 Лимонове, то в голове сразу щёлкает калькулятор на 5-8 лимончиков.
И если кто-то из звена утверждает без выездной проверки 40=, то другие начинают подозревать, что их банально кинули. И соответственно реагируют. Но это не у нас, а там, в Гондурасе.

(7) Это все любопытно, но вопрос в том, как можно на первичных документах обосновать раздельный учет входящего НДС?

А чего тут сложного? Это же материалы? Известно точно сколько их ушло на две деятельности. Не вижу проблем. Это же не услуги.

(9) Материалы никуда не ушли, они лежат на складе. Раздельный учет НДС предполагает определение вида деятельности в момент покупки.

Вы утверждаете, что ваша фирма пушистая, так давайте рассмотрим два пути.
В 1кв зарегили в журнале поступивших сф на 40 ндс. Пусть в конце концов три четверти материалов уйдёт на проект и четверть на обычную деятельность. В конце по факту из 40 будет отражено в КП 10, а 30 увеличит себестоимость.

1. В 1кв так и остаётся декларация ндс с нулём к вычету. В дальнейшем по частям по одной этой крупной сф спокойно делаются частичные записи вычета, пока не наберётся 10.

2. Сдаёте уточнёнку за 1кв на 40 к вычету. Затем каждый раз частями убираете из КП в итоге 30.
Оно вам надо? Если на тот же итог выходите через жопу и подставляясь каждый раз под углублённые проверки?

Но вы свободные люди свободной страны, поэтому делайте что хотите.

(10)[Раздельный учет НДС предполагает определение вида деятельности в момент покупки.]
раздельный учет НДС запасов постулирует отсутствие вида деятельности в момент перехода права собственности