Собственно документом распределения заведено распеределение.

Заполняется документ Отражения зп в бу

Оклад распределяется.
А доп начисление - компенсация за дистанционную работу не распределяется.

Собственно каким параметром зуп определяет что распределять, а что нет? Это настраивается или где то зашито в коде?

Если верить ИТС "В указанных долях распределяются все начисления сотрудника, кроме тех, для которых в форме вида начисления или при вводе расчетного документа установлен особый способ отражения в учете." https://its.1c.ru/db/staff1c/content/33741/zup30

Что значит особый способ начисления?

Есть сотрудник. У него на вкладке Начисления указаны 4 вида начисления. (Оклад, Районный коэффициент, Северная надбавка, Компенсация расходов (дист работа))

Есть документ Начисление зп и взносов.

Там у сотрудника 4 суммы по этим начислениям.

В отражение при заполнение все суммы кроме "Компенсация расходов..." распределяются, а эта сумма - нет.