Всем привет.

Сотруднику завели вычет другого работодателя в размере 4000 руб. Соответственно вычет на этот год исчерпан.

Далее заводим документ материальной помощи. В нём указываем сумму 2000 руб. Вычет не применился, но заполнилась колонка "Скидка по взносам". Разве она должна заполняться когда лимит вычета израсходован? В чём ошибка?

Есть декларация 3-НДФЛ, но нет таковой 3-Взносы. Почему?
Потому что база по налогу ФЛ едина и суммируется по всем работодателям, источникам дохода.
Базы же по взносам независимы и не суммируются по работодателям-страхователям. Данному работодателю фиолетовы расчёты других и какие там у себя они давали скидки.

(1) Здесь
https://buhexpert8.ru/1s-zup/ndfl-i-strahovye-vznosy-1s-zup/ndfl-ischislennyj-uderzhannyj-i-perechislennyj/vychety-po-chastichno-oblagaemym-dohodam-s-predydushhego-mesta-raboty-zup-3-1-11.html
написано:
По страховым взносам необходимости в получении информации о предоставленных вычетах с предыдущего места работы нет, т.к. в этом случае вычеты по частично облагаемым доходам предоставляются по каждому месту работы сотрудника.

(1) Получается скидка в 4000 руб по страховым взносам предоставляется как по старому, так и по новому месту работы.

(3) Да, потому что взносы платит работодатель. Каждый работодатель отдельно. платит взносы. и отдельно. представляет вычет.
А налог на доходы платит лично физическое лицо (а работодатель в случае НДФЛ выступает в качестве передаточного звена между физлицом и налоговой, и не более. работодатель-передаст, короче)). А оно (физлицо) едино и неповторимо. независимо от того, где работает. Поэтому вычет по НДФЛ получает физлицо, и получает его один раз, как одно физлицо.

Тебе проще запомнить старую поговорку- каждый баран висит за свою ногу и отвечает за свои яйца.
Каждый из работодателей - за свои, а физическое лицо - за свои.