(3) Правильно заданный вопрос уже содержит половину ответа...
Обрабатывать уже выведенный документ, идея так скажем, странная. Иногда конечно это требуется для оформления, которое трудно сделать в СКД (например шапки таблицы). Но обход данных уже выведенных в табличный документ для постобработки - такое впервые слышу. Может лучше подумать о поэлементном выводе? Например так
https://infostart.ru/1c/articles/1290155/