2 разных релиза, установлены в разные папки, запущены на разных портах.

Но, насколько я понимаю, comcntr.dll постоянно используется для обмена между базами и пр.

Как они будут её делить?

(0) Зачем их делить? Насколько я понимаю, для каждого релиза comcntr.dll свой

+ (1) https://infostart.ru/1c/tools/610960/

к сожалению кроме как переименовать один ком объект реально совместно использовать нельзя...

ну или использовать какие-то обертки...

тут дело в том, что пространство имен ком объектов на сервере одно и невозможно юзать два одинаковых имени

хотя лично сталкивался когда к одной Файловой базе цеплялись разные версии платформы одновременно

(2) Задача сделать так, чтобы не требовалось вносить изменения в существующие конфигурации.

Видимо, не судьба.

(4) остался вопрос, зачем использовать два разных релиза?

(5) пиратка )

(0) Получится не со всеми версиями и это геморрой, полной инструкции по которому вы не найдете. Нормально и без геморроя получалось только с 8.2 и 8.3. Даже если использовать обертки с разными именами (кстати, это уже потребует изменения конфигурации, что не соответствует вашему ТЗ), некоторые версии используют одинаковые зависимости, которые несовместимы между собой (т.е. будет работать что-то одно, а то, что не будет работать, будет валиться с ошибкой чего-то там в dllhost). Тут на форуме Volkov раньше часто на эту тему раньше писал, я так понимаю, в итоге смирился.
Обмены типовые перевести на веб-сервисы или файлы, нетиповые - тоже или на шину. Com не нужен.

(6) Пиратка то здесь при чём?

Разные базы под разными релизами - несколько очень старых, которые не должны обновляться, остальные - постоянно обновляемые.

(0)https://infostart.ru/1c/articles/685924/

Всем спасибо, купим вторую лицензию на сервер 1С Предприятия и вынесем на отдельную виртуалку.