Без проблем :
1. Дописываешь запрос в консоли запросов в предприятии
2. В расширении меняешь в отчете текст запроса твоего отчета в процедуре ПриКомпоновкеРезультата
Процедура ПриКомпоновкеРезультата(ДокументРезультат, ДанныеРасшифровки, СтандартнаяОбработка)
СхемаКомпоновкиДанных.НаборыДанных.Получить(0).Запрос = СтрЗаменить(СхемаКомпоновкиДанных.НаборыДанных.Получить(0).Запрос,
"Фрагмент исходного запроса",
"Фрагмент измененного запроса");
КонецПроцедуры