"поиск" - вверх вправо (по моему так общепринято), или вверх влево...
"навигация" - будет огромным деревом как в длинну так и в ширину (за счет длинных названий), по этому ее нужно делать последней в колонке. панель инструментов нужно перенести над навигацией или еще куда
"цвет" - почему-бы не сделать в цветах мисты?
"инструменты" - по чему-бы не сделать как "содержание" (прилепленая раскрывашка)
"подразделы" и "страницы в этом разделе" - меня совсем не воодушевили, хотя и предложения своего нет...