Короче, есть необходимость опубликовать базу дважды. Один ра для работы пользователей через ВЕб-клиента. второй раз - для работы веб-сервисов, с анонимной аторизацией.  
Но две таких публикации на одном IIS приводят к конфликту (либо не работает анонимная авторизация, либо в пользовательской происходит авторизация под служебным пользователем)
У меня есть идея опубликовать повторно вообще на другой машине с другим  IIS. Чтобы уже на этом настроить анонимную авторизацию, А на первом оставить для интерактивного входа пользователей.

сработает

ок, спасибо

(2) Но я лично не пробовал. Просто исходя из теоретических соображений. Так что отпишись по результатам

Нормально будет работать.

На апачи публикация на 2-х серверах работает

(0) Может поиграться с узлами/пулами?

"(либо не работает анонимная авторизация, либо в пользовательской происходит авторизация под служебным пользователем)" // На уровне чего (в ИИС) настроена анонимная авторизация / служебный пользователь? Ну там сервер, пул приложений, сайт?

2(7) Если анонимно делаю на уровне сайта/приложения(то есть буквально прописываю доменного пользователя, пароль, в базе для одного пользователя также прописываю его в данных аутентификации ос), то работает интерактивный вход, но НЕ работает анонимная авторизация (при попытке зайти браузером по адресу сервиса - ошибка 401.2).
если анонимную авторизации прописываю на уровне сервера, то анонимная авторизация работает - вход по адресу веб-сервиса авторизацию не запрашивает, и выдает нужный ХМЛ, но также срабатывает анонимная авторизация и для всех опубликованных баз/сайтов  (ну типа они наследуют настройки сервера). И если для большинства баз в этом ничего такого нет, то для основной публикации этой же базы собственно происходит вход под служебным пользователем 1С, которому прописан доменный пользователь, под которым осуществляет анонимную аутентификацию ИИС)

Короче, я опубликую веб-сервис на другом иисе, а с настройками анонимной аутентификации позже поиграюсь